PROGRAMA DE BIOLOGÍA DE SISTEMAS APLICADA Y BIOLOGÍA SINTÉTICA

Participantes

Líneas de investigación

En nuestro grupo se llevan a cabo diversas líneas de trabajo en biología de sistemas y biología sintética de microorganismos. Estas incluyen la bioprospección de microorganismos de ambientes hostiles, la genómica bacteriana y ambiental, la modelización metabólica y el análisis de datos ómicos (transcriptómica, proteómica, metabolómica), y la producción biotecnológica de productos de interés industrial.

En relación con la PTI se establecen las siguientes líneas de investigación principales:

  • Modelización metabólica para establecer modelos metabólicos a escala genómica de la  fastidiosacon el objetivo de entender y predecir cómo funciona su metabolismo en diferentes condiciones de crecimiento, lo cual facilitará el desarrollo de dianas para un posible tratamiento con antimicrobianos, pero también la posibilidad de encontrar medios de cultivos que permitan cultivar los aislados de manera más eficiente.
  • Se estudiará también el pangenoma de esta especie para tratar de encontrar cual es el núcleo genómico que define a la especie y encontrar posibles diferencias entre especies en los genes de patogenicidad.
  • Análisis bioinformático de datos ómicos para para integrarlos en el modelo metabólico y validarlo.

 

GRUPO VIROLOGÍA AMBIENTAL Y BIOMÉDICA

Participantes

  • Pilar Domingo Calap (investigadora principal)
  • Mireia Bernabéu Gimeno (investigadora predoctoral)
  • Miranda Tomás Tomás (técnico de apoyo a la investigación)

Líneas de investigación

El Laboratorio de Virología Ambiental y Biomédica se encuentra en el Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio, UV-CSIC). La investigación del laboratorio se centra en el aislamiento y la detección de virus en la naturaleza con aplicaciones biomédicas y biotecnológicas. La virología ambiental, la emergencia viral, la evolución del virus y la búsqueda de nuevos bacteriófagos en el contexto biomédico son las líneas de investigación principales. Los bacteriófagos son ubicuos en el ambiente y presentan una diversidad enorme, siendo una fuente casi inagotable para el desarrollo de nuevas terapias contra bacterias patógenas, siendo de gran prioridad debido a la aparición de bacterias resistentes a múltiples fármacos. Por otro lado, el laboratorio está interesado en la epidemiología ambiental, principalmente en la detección de virus emergentes en aguas residuales y otros ambientes naturales, como herramienta para la monitorización de las poblaciones y detección temprana en la vigilancia poblacional. Además, el grupo está interesado en la investigación traslacional, a través de su spin-off Evolving Therapeutics SL, con fines biomédicos y biotecnológicos.

En relación con la PTI se establecen las siguientes líneas de investigación principales:

  • Estudio genómico de  fastidiosacon el objetivo de estudiar profagos presentes en los genomas bacterianos, así como sistemas de defensa anti-fagos.
  • Aislamiento y caracterización de nuevos fagos frente a fastidiosa, estudios de actividad in vitro y validación en laboratorio.
  • Producción de fagos para su uso como herramientas de biocontrol.
  • Validación de los fagos en planta y campos de cultivo.
  • Estudios metagenómicos en planta para el estudio de la modulación del microbioma tras la terapia con fagos.

WEB: Virología Ambiental y Biomédica